Because of the continuous introduction of germplasm from abroad, some collections have a high number of accessions, making it difficult to explore the genetic variability present in a germplasm bank for conservation and breeding purposes. Therefore, the aim of this study was to quantify and analyze the structure of genetic variability among 500 common bean accessions to construct a core collection. A total of 58 SSRs were used for this purpose. The polymorphism information content (PIC) in the 180 common bean accessions selected to compose the core collection ranged from 0.17 to 0.86, and the discriminatory power (DP) ranged from 0.21 to 0.90. The 500 accessions were clustered into 15 distinct groups and the 180 accessions into four distinct groups in the Structure analysis. According to analysis of molecular variance, the most divergent accessions comprised 97.2% of the observed genetic variability present within the base collection, confirming the efficiency of the selection criterion. The 180 selected accessions will be used for association mapping in future studies and could be potentially used by breeders to direct new crosses and generate elite cultivars that meet current and future global market needs.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar genotipicamente, e construir o mapa de ligação e mapear locos associados a características quantitativas (QTL) de desempenho e carcaça no cromossomo 5 de linhagens brasileiras galinhas. Utilizou-se uma população F2 CTCT, resultante do acasalamento entre machos da linhagem de postura CC e fêmeas da linhagem de corte TT. Um total de 356 animais foi genotipado com 11 marcadores microssatélites. A caracterização genotípica foi realizada pela estimação dos seguintes parâmetros genotípicos: conteúdo de informação polimórfica (0,45-0,69), heterozigosidades observada (0,48-1,00) e esperada (0,48-0,74), e número de alelos por loco (3-5). Empregou-se o mapeamento por intervalo combinado à modelagem fenotípica por modelo misto, no mapeamento de QTL. O comprimento do mapa de ligação foi de 174,7 cM. Não foram constatadas inversões entre o mapa obtido, o mapa consenso e o genoma. Foram mapeados nove QTL, dos quais sete foram sugestivos ("log of odds", LOD<1,5) e dois significativos ao nível cromossômico (LOD>3,0). Seis destes QTL são inéditos: conversão alimentar e eficiência alimentar dos 35 aos 41 dias de idade (significativo), pesos de cabeça e fígado, e triglicerídeos e triglicerídeos+colesterol. A população CTCT apresenta variabilidade genotípica, o mapa de ligação é similar ao mapa consenso e ao genoma, e novos QTL foram mapeados.

The objective of this work was to genotype, construct the linkage map and map quantitative trait loci (QTL) associated with performance and carcass on chromosome 5 of Brazilian chickens lines. It was used a F2 CTCT chicken population, resulting from the crossing of males from a CC layer line with females from a TT broiler line. A total of 356 animals were genotyped with 11 microsatellite markers. Genotypic characterization was carried out by the estimation of the following genotypic parameters: polymorphic information content (0.45-0.69), observed (0.48-1.00) and expected (0.48-0.74) heterozygosities, and number of alleles per locus (3-5). QTLmapping used interval mapping combined with phenotypic modeling via mixed model. The length of the linkage map was 174.7 cM. No inversions were found between the obtained map, the consensus map, and the genome. Nine QTL were mapped, of which seven were suggestive (log of odds, LOD<1.5) and two significant at the chromosome level (LOD>3.0). Six of these QTL are original: feed conversion and feed efficiency from 35 to 41 days of age (significative), weight of head and liver, and triglycerides and triglycerides+cholesterol. The CTCT population shows genotypic variability, the linkage map is similar to consensus map and genome, and new QTL were mapped.

A wide array of molecular markers has been used to investigate the genetic diversity among common bean species. However, the best combination of markers for studying such diversity among common bean cultivars has yet to be determined. Few reports have examined the genetic diversity of the carioca bean, commercially one of the most important common beans in Brazil. In this study, we examined the usefulness of two molecular marker systems (simple sequence repeats - SSRs and amplified fragment length polymorphisms - AFLPs) for assessing the genetic diversity of carioca beans. The amount of information provided by Roger's modified genetic distance was used to analyze SSR data and Jaccards similarity coefficient was used for AFLP data. Seventy SSRs were polymorphic and 20 AFLP primer combinations produced 635 polymorphic bands. Molecular analysis showed that carioca genotypes were quite diverse. AFLPs revealed greater genetic differentiation and variation within the carioca genotypes (Gst = 98% and Fst = 0.83, respectively) than SSRs and provided better resolution for clustering the carioca genotypes. SSRs and AFLPs were both suitable for assessing the genetic diversity of Brazilian carioca genotypes since the number of markers used in each system provided a low coefficient of variation. However, fingerprint profiles were generated faster with AFLPs, making them a better choice for assessing genetic diversity in the carioca germplasm.

Populações experimentais de frangos tem sido desenvolvidas pelo mundo para mapeamento de QTLs, mas a caracterização genotípica delas não é normalmente apresentada. O objetivo deste estudo foi caracterizar genotipicamente duas gerações F1 recíprocas e suas linhagens parentais com base na estimação de parâmetros genotípicos. Estas gerações F1 originaram duas populações brasileiras referências para mapear QTLs. Os parâmetros avaliados foram: conteúdo de informação polimórfica (PIC), heterozigosidades observada e esperada e número de alelos por loco nos cromossomos 1, 3 e 4. Todos os animais parentais e F1 de ambas as populações foram usados, em um total de 83 animais: 14 de uma linhagem de corte (TT) e 14 de uma linhagem de postura (CC), e 55 de suas gerações recíprocas F1. Tanto as linhagens como as populações referências foram desenvolvidas no Centro Nacional de Pesquisa de Suínos e Aves (EMBRAPA), Brasil. Os genótipos de todos os animais foram obtidos a partir de 34 marcadores microssatélites localizados nos cromossomos 1 (13), 3 (12) e 4 (9). Com base na amostragem realizada, as duas linhagens exibiram um total de 163 alelos, dos quais 31 (31,1%) e 44 (33,0%) foram oriundos exclusivamente de CC e TT, respectivamente, com freqüências alélicas que variaram de 0,03 a 0,82. A heterozigosidade observada foi maior (0,68-0,71) em ambas as gerações F1 do que em suas linhagens fundadoras devido ao desequilíbrio de ligação. Finalmente, as duas linhagens parentais possibilitaram a obtenção de gerações recíprocas F1 com valores elevados de PIC (0,50-0,52) e heterozigosidade observada, bem como com um número satisfatório de alelos por loco (4,06-4,32). Estes resultados permitirão comparar e selecionar famílias e marcadores microssatélites mais informativos em estudos de QTLs, reduzindo os custos de genotipagem.

Chicken experimental populations have been developed worldwide for QTL mapping, but their genotypic characterizations are not usually discussed. The objective of this study was to characterize genotypically two F1 reciprocal generations and their parental lines based on the estimation of genotypic parameters. These F1 generations originated two Brazilian reference populations to map QTL. The evaluated parameters were polymorphic information content (PIC), observed and expected heterozygosities and number of alleles at microsatellite loci on chromosomes 1, 3 and 4. All parental and F1 chickens from both populations were used totalling of 83 chickens: 14 from a broiler (TT) and 14 from a layer line (CC) and 55 from their reciprocal F1 generations. The chicken lines and the resource populations were developed at the National Research Center for Swine and Poultry (EMBRAPA), Brazil. Genotypes from all animals were obtained from 34 loci on chromosomes 1 (13), 3 (12) and 4 (9). Based on the sampling, we found that the two lines exhibited a total of 163 different alleles, of which 31 (31.1%) and 44 (33.0%) alleles were unique in CC and TT lines, respectively, with allelic frequencies ranging from 0.03 to 0.82. The observed heterozygosity was higher (0.68-0.71) in both F1 generations than in their founder lines due to linkage disequilibrium. Finally, the two chicken lines used as founders created two F1 reciprocal generations with high levels of PIC (0.50-0.52) and observed heterozygosity, as well as satisfactory number of alleles per locus (4.06-4.32). Our results will allow to compare and select families with highly informative microsatellite markers for QTL studies, reducing genotyping costs.

O amendoim (Arachis hypogaea) possui genoma AB e é uma das mais importantes culturas oleaginosas em todo o mundo. Os principais problemas da cultura no Brasil são as doenças fúngicas. Várias espécies do gênero Arachis são resistentes a pragas e doenças. Este trabalho visou a identificar espécies silvestres pertencentes à seção Arachis associadas aos genomas A ou B (ou " não-A" ) do amendoim que são resistentes à mancha castanha (Cercospora arachidicola), mancha preta (Cercosporidium personatum) e ferrugem (Puccinia arachidis). Para a identificação de genótipos resistentes a doenças fúngicas, bioensaios utilizando folhas destacadas foram realizados em condições de laboratório, com inoculação artificial, temperatura controlada de 25ºC e fotoperíodo de 10h luz/14h escuro, por 20-42 dias, de acordo com a espécie fúngica. A maioria dos acessos das espécies silvestres foram mais resistentes que os acessos de A. hypogaea para uma, duas ou todas as espécies fúngicas estudadas. Arachis monticola, considerada como o possível ancestral tetraplóide ou como um derivativo de A. hypogaea, também mostrou-se mais suscetível a Cercosporidium personatum e Puccinia arachidis, quando comparado à maioria das espécies silvestres. Portanto, acessos de germoplasma silvestre com genoma A ou B estão disponíveis para serem utilizados na introgressão de genes de resistência a doenças fúngicas no amendoim.

Groundnut (Arachis hypogaea) has an AB genome and is one of the most important oil crops in the world. The main constraints of crop management in Brazil are fungal diseases. Several species of the genus Arachis are resistant to pests and diseases. The objective of our experiments was to identify wild species belonging to the taxonomic section Arachis with either A or B (or " non-A" ) genomes that are resistant to early leaf spot (Cercospora arachidicola), late leaf spot (Cercosporidium personatum) and rust (Puccinia arachidis). For the identification of genotypes resistant to fungal diseases, bioassays with detached leaves were done in laboratory conditions, with artificial inoculation, a controlled temperature of 25ºC and a photoperiod of 10 h light/14 h dark, for 20-42 days, depending on the fungi species. Most of the accessions of wild species were more resistant than accessions of A. hypogaea for one, two or all three fungi species studied. Arachis monticola, considered to be a possible tetraploid ancestor or a derivative of A. hypogaea, was also more susceptible to Cercosporidium personatum and Puccinia arachidis, as compared to most of the wild species. Therefore, wild germplasm accessions of both genome types are available to be used for the introgression of resistance genes against three fungal diseases of peanut.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência, na construção de mapas genéticos, dos algoritmos seriação e delineação rápida em cadeia, além dos critérios para avaliação de ordens: produto mínimo das frações de recombinação adjacentes, soma mínima das frações de recombinação adjacentes e soma máxima dos LOD Scores adjacentes, quando usados com o algoritmo de verificação de erros " ripple" . Foi simulado um mapa com 24 marcadores, posicionados aleatoriamente a distâncias variadas, com média 10 cM. Por meio do método Monte Carlo, foram obtidas 1.000 populações de retrocruzamento e 1.000 populações F2, com 200 indivíduos cada, e diferentes combinações de marcadores dominantes e co-dominantes (100% co-dominantes, 100% dominantes e mistura com 50% co-dominantes e 50% dominantes). Foi, também, simulada a perda de 25, 50 e 75% dos dados. Observou-se que os dois algoritmos avaliados tiveram desempenho semelhante e foram sensíveis à presença de dados perdidos e à presença de marcadores dominantes; esta última dificultou a obtenção de estimativas com boa acurácia, tanto da ordem quanto da distância. Além disso, observou-se que o algoritmo " ripple" geralmente aumenta o número de ordens corretas e pode ser combinado com os critérios soma mínima das frações de recombinação adjacentes e produto mínimo das frações de recombinação adjacentes.

The objective of this work was to evaluate the efficiency for the construction of genetic linkage maps of the algorithms seriation and rapid chain delineation, as well as the criteria: product of adjacent recombination fractions, sum of adjacent recombination fractions, and sum of adjacent LOD Scores, used with the ripple algorithm. A genetic linkage map was simulated containing 24 markers with random distances between them, with an average of 10 cM. Using the Monte Carlo method, 1,000 backcross populations and 1,000 F2 populations were simulated. The populations comprised 200 individuals each, as well as different combinations of dominant and codominant markers (100% codominant, 100% dominant and mixture containing 50% codominant and 50% dominant). It were also simulated 25, 50 e 75% of missing data. It was observed that both algorithms presented similar performance, and were sensitive to the presence of dominant markers, which makes it difficult to get estimates with good accuracy for both order and distance. Moreover, the algorithm ripple, when applied with the criteria sum of adjacent recombination fractions and product of adjacent recombination fractions, increased the number of correct orders.

Os testes de hipóteses têm sido amplamente utilizados, em análise de variância, para se concluir a respeito das fontes de variação. O teste F, em análise de variância para tratamentos com mais de um grau de liberdade, proporciona informações gerais, relacionadas com o comportamento médio dos tratamentos. Informações mais específicas são obtidas por meio de desdobramentos ortogonais dos graus de liberdade, comumente empregando contrastes. Entretanto, essa técnica torna-se complexa e de difícil implementação à medida que o número de tratamentos aumenta. Diante desse fato, utilizando-se como exemplo do uso da técnica, dados provenientes de um experimento de competição entre nove híbridos de milho, classificados em três tipos (simples, duplo e triplo), no delineamento em blocos casualizados, explicitou-se o emprego das variáveis auxiliares, que facilitam o desdobramento ortogonal dos graus de liberdade de tratamentos. Cada fator no modelo, após a decomposição, recebe uma codificação específica, tendo como valor, o nível do fator quando o tratamento for desse tipo, ou valor zero em caso contrário. O uso de variáveis auxiliares é uma forma simples e prática para determinar diferenças dentro dos grupos de interesse, embora não seja possível testar diretamente diferenças entre os grupos, o que pode também ser feito com a função CONTRAST do PROC GLM do SAS, mas não de forma tão simples.

Hypothesis tests have been largely used in analysis of variance in order to study sources of variation. The F test for treatments when there are more than one degree of freedom provides only a general information, related to the comparison of means. More specific information is obtained by orthogonal decomposition of the degrees of freedom, often using contrasts. However, this technique becomes complex and difficult to implement as the number of treatments increases. In order to overcome this problem it was studied auxiliary variables to test differences among groups and facilitate orthogonal decomposition of treatment degrees of freedom. It was used as example , experimental data from a maize trial consisting of nine hybrids, classified as simple, double or triple assayed in randomized complete block design. After the decomposition, each factor in the model, receives a specific codification, the value referring the level of the factor when the treatment is of that type or, alternatively, zero if not. The use of auxiliary variables showed to be a usefull and simple way to test differences between groups. This can be also done with the CONTRAST function of the PROC GLM of SAS software, but with a more complex procedure.

A variabilidade de ambientes pode afetar o desempenho de linhagens de feijoeiro geradas nos programas de melhoramento e também dos cultivares em uso. Assim, foram avaliadas a adaptabilidade e a estabilidade de produção de grãos de 18 cultivares e linhagens de feijoeiro em 23 ambientes (combinações de épocas, anos e locais), no Estado de São Paulo. 'IAC-Carioca' e 'IAC-Carioca Eté' foram os cultivares usados como padrões de grãos tipo carioca, enquanto 'FT-Nobre' e 'IAC-Una' foram padrões para grãos pretos. Os ensaios foram instalados em blocos completos casualizados, com quatro repetições e parcela útil de duas linhas centrais de cinco metros. Os parâmetros de estabilidade foram estimados pelos métodos dos Desvios da Produtividade Máxima (MYD) e da Análise da Interação Multiplicativa e dos Efeitos Principais Aditivos (AMMI). Ambos produziram resultados congruentes em termos de identificação dos cultivares mais estáveis, porém a maior estabilidade esteve sempre associada à maior produtividade no MYD. 'MA-733327' e 'LP 9637' foram os cultivares mais indicados para o conjunto das épocas, águas e inverno, enquanto LP 9637 e FT-Nobre foram os mais estáveis na seca. MYD reuniu simplicidade de procedimento, facilidade de interpretação de resultados, unicidade de parâmetros e associação entre estabilidade e produtividade. Por sua vez, AMMI, além de informar sobre os ambientes, facilitou a identificação dos cultivares estáveis por inspeção visual. Porém sua fundamentação complexa, visto que combina técnicas uni e multivariadas, dificulta seu uso generalizado em programas de melhoramento.

The performance of bean lines brought forth in breeding programs or of cultivars in use can be affected by environmental variability. The adaptability and stability of grain yield of 18 common bean cultivars and lines in 23 environments (combinations of seasons, years and locations) were evaluated in the State of São Paulo, Brazil. 'IAC-Carioca' and 'IAC-Carioca Eté' were used as standard cultivars for the carioca grain type, while 'FT-Nobre' and 'IAC-Una' represented the standard for black grains. The experiment was set up in a randomized complete block design with four replications and plots consisting of two, two central five meters rows flanked by border rows. Stability parameters were estimated by the methods Maximum Yield Deviations (MYD) and by the Additive Main Effects and Multiplicative Interaction Analysis (AMMI). For the identification of the most stable cultivars, the two methods led to consistent results, although by MYD the highest stability was always associated to the highest yield. 'MAC-733327' and 'LP 9637' were the most suitable cultivars and lines for the joint seasons, while 'LP 9637' and 'FT-Nobre' were the most suitable for the dry season. The MYD method combined a simple procedure, easiness of result interpretation, uniqueness of parameters, and association between stability and yield. On the other hand, the AMMI method simplified the identification of stable cultivars by visual inspection, also providing information on the environments. However, the complex nature which combines uni-and multivariate techniques hampers its widespread use in breeding programs.

The objective of this study was to evaluate whether different similarity coefficients used with dominant markers can influence the results of cluster analysis, using eighteen inbred lines of maize from two different populations, BR-105 and BR-106. These were analyzed by AFLP and RAPD markers and eight similarity coefficients were calculated: Jaccard, Sorensen-Dice, Anderberg, Ochiai, Simple-matching, Rogers and Tanimoto, Ochiai II and Russel and Rao. The similarity matrices obtained were compared by the Spearman correlation, cluster analysis with dendrograms (UPGMA, WPGMA, Single Linkage, Complete Linkage and Neighbour-Joining methods), the consensus fork index between all pairs of dendrograms, groups obtained through the Tocher optimization procedure and projection efficiency in a two-dimensional space. The results showed that for almost all methodologies and marker systems, the Jaccard, Sorensen-Dice, Anderberg and Ochiai coefficient showed close results, due to the fact that all of them exclude negative co-occurrences. Significant alterations in the results for the Simple Matching, Rogers and Tanimoto, and Ochiai II coefficients were not observed either, probably due to the fact that they all include negative co-occurrences. The Russel and Rao coefficient presented very different results from the others in almost all the cases studied and should not be used, because it excludes the negative co-occurrences in the numerator and includes them in the denominator of their expression. Due to the fact that the negative co-occurrences do not necessarily mean that the regions of the DNA are identical, the use of coefficients that do not include negative co-occurrences was suggested.

O objetivo deste trabalho foi selecionar descritores botânicoagronômicos quantitativos para caracterizar acessos de cupuaçuzeiro [Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum]. Foram avaliados 53 descritores associados a características de folha (14), de flor (18), de fruto (16), e descritores agronômicos (5). No descarte dos descritores, foi empregada a técnica multivariada de componentes principais, em duas etapas. Na primeira, a seleção aconteceu dentro de cada grupo. Em seguida, foi realizada análise conjunta para a seleção final. Três critérios foram adotados para descarte das variáveis. Foram descartados 34 descritores, representando redução de 64% dos inicialmente considerados. A lista mínima de descritores para o cupuaçuzeiro ficou assim composta: comprimento do pecíolo foliar, espessura do limbo foliar, largura do acume foliar, angulação das nervuras de base, comprimento do botão estriado, comprimento do pedúnculo floral, diâmetro do pedúnculo floral, diâmetro do ovário, número de óvulos, comprimento da lâmina da pétala, comprimento dos estaminóides, diâmetro transversal da semente, semente chocha, acidez, brix, pH, número de botões caídos ao solo, número de frutos imaturos caídos precocemente e número de vassouras-de-bruxa produzidas.

The objective of this work was to select morphological and agronomic quantitative descriptors to characterize accessions of cupuaçuzeiro [Theobroma grandiflorum (Willd. ex Spreng.) Schum]. Fifty three descriptors were evaluated, including 14 from leaves, 18 from flowers, 16 from fruits, and 5 agronomic traits. To discard redundant or non-discriminating descriptors, a two step multivariate analysis of principal components was applied. The first phase included the selection of descriptors within each group of characteristics individually (leaf; flower; fruit; agronomic). Based on the descriptors selected in this first phase, a joined analysis of principal components for the final selection was done. Three criteria for variable exclusion were adopted. Thirty four descriptors were excluded, representing a reduction of 64%. A minimal list of descriptors for cupuaçuzeiro was proposed, including leaf length, leaf thickness, leaf apex width, leaf base vein angle, flower bud length, flower peduncle length, flower peduncle diameter, ovary girth, number of ovules, flower petal lamina length, staminode length, seed width, flat seeds, acidity, brix, pH, number of fallen flowers buds, number of abscised immature pods and number of witches-brooms.

Realizou-se o presente trabalho com o intuito de avaliar a influência do sistema de criação (intensivo e semi-intensivo) no desempenho (peso corporal e conversão alimentar), na condição fisiológica sob estresse térmico (temperatura retal, freqüência respiratória e hematócrito) e comportamento (freqüência ao pasto) de frangos de corte. Foram utilizadas quatro linhagens de frangos de corte, duas tipo caipira e duas comerciais. Para avaliação do desempenho e condição fisiológica das aves nas idades de 45, 55, 65 e 75 dias, instalou-se um experimento no qual as aves foram alojadas em boxes constituídos de 4,5 m² de área interna (abrigo) e 35 m² de área de pastejo com lotação de 35 aves/box. Outro experimento foi instalado para avaliação da freqüência das aves ao pasto entre o 35º e 75º dia de idade. Uma das linhagens avaliadas não demonstrou ser adaptada ao sistema semi-intensivo de criação. Verificaram-se diferenças significativas nos parâmetros de desempenho e de condição fisiológica das aves nos dois sistemas. Na criação semi-intensiva obtiveram-se menores valores para temperatura retal, taxa respiratória e hematócrito e melhores valores de peso corporal e conversão alimentar. Concluiu-se que a criação semi-intensiva proporcionou condições que aumentaram o bem-estar das aves, tendo influenciado positivamente o desempenho e a condição fisiológica das linhagens avaliadas, mesmo sob condições de estresse térmico.

The objectives of this research were to evaluate the influence of rearing systems (intensive or semi-intensive) on the performance (body weight and feed efficiency), chicken physiological condition under heat stress (rectal temperature, respiratory frequency and hematocrit) and behavioural parameters (frequency in the pasture areas) of broilers lines. To evaluate broiler's performance and physiological condition on the ages of 45, 55, 65 and 75 days one experiment was carried out in boxes with 4,5 m² of inside area and 35 m² of outside area were 35 broilers were reared in each box. Another experiment was carried out to evaluate the frequency of broilers it the pasture areas from 35 to 75 days of age. One of the evaluated lines did not show adaptation to the semi-intensive rearing system. Significant differences were found in broilers performance and physiological conditions in both systems. In the semi-intensive rearing system the rectal temperature, respiratory frequency, hematocrit and feed efficiency were smaller and body weight larger than in the intensive rearing system. It was concluded that the semi-intensive rearing system provided conditions that increased broilers welfare and positively influenced the physiological conditions and performance of the broilers.

No melhoramento de milho (Zea mays L.), a utilização de cruzamentos dialélicos visando identificação de combinações superiores é uma prática comum. Esta metodologia visa estimar a capacidade de combinação dos materiais avaliados. Neste trabalho, cinco linhagens endogâmicas foram avaliadas quanto às capacidades gerais (CGC) e específica (CEC) de combinação, utilizando o esquema de dialelo completo. Os híbridos simples produzidos entre estas linhagens foram avaliados em sete ambientes, juntamente com duas testemunhas, tendo-se utilizado o delineamento de blocos casualizados. Avaliaram-se os caracteres: produção de grãos, altura da planta, altura da espiga, posição relativa da espiga e prolificidade. Realizou-se a análise dialélica, seguindo uma adaptação do método IV de Griffing, além das análises de estabilidade e adaptabilidade dos híbridos. Detectaram-se diferenças significativas para tratamentos e ambientes para todos os caracteres. A interação genótipos por ambientes foi significativa para maioria dos caracteres. As CGCs foram significativas para todos os caracteres, enquanto que a CEC foi não significativa apenas para posição relativa da espiga. Para o caráter produção de grãos, tanto os efeitos aditivos (CGC) quanto não aditivos (CEC) foram importantes, enquanto que para os demais caracteres, houve predominância dos efeitos aditivos. O híbrido mais produtivo foi obtido entre as linhagens L-08-05F e L-38-05D. Suas linhagens apresentaram elevadas CGCs e seu híbrido, elevada CEC, além de ter sido responsivo à melhoria das condições ambientais e razoavelmente estável. O segundo híbrido mais produtivo, L-46-10D x L-08-05F, mostrou ampla adaptabilidade e estabilidade.

The utilization of diallel crosses for identification of superior combinations is a common practice in maize (Zea mays L.) breeding programs. This methodology allows the estimation of the combining ability of genotypes being evaluated. In this work, five inbred lines were evaluated as to their general (GCA) and specific (SCA) combining abilities, by using a complete diallel scheme. The single-crosses produced between these inbred lines were evaluated in seven environments, along with two checks, by using a randomized complete block design. Traits analized were: grain yield, plant height, ear height, ear placement, and prolificacy. A diallel analysis was carried out, following an adaptation of Griffing's method IV, in addition to hybrid stability and adaptability analyses. Significant differences were detected for entries and environments for all traits. The interaction genotype vs. environment was significant for all traits. GCA's were significant for all traits, while SCA's were non-significant only for ear placement. For grain yield, both additive (GCA) and non-additive (SCA) effects were important, while for the remaining traits additive effects were more important. The high yielding single-cross was obtained from the cross of lines L-08-05F and L-38-05D. Those inbred lines showed higher GCA's and their cross also had high SCA; also, it is responsive to environment improvements and reasonably stable. The second in rank high yielding single-cross, L-46-10D x L-08-05F, showed wide adaptability and stability.

A proteína do milho (Zea mays L.) é considerada como de baixa qualidade, pois apresenta nível reduzido dos aminoácidos essenciais lisina e triptofano. Uma alternativa para contornar esse problema consiste na introdução do gene opaco-2, que eleva a quantidade desses aminoácidos, embora apresente efeitos pleiotrópicos negativos em caracteres agronômicos relacionados à produtividade. O objetivo deste trabalho foi verificar a viabilidade de melhorar a qualidade protéica do milho com uso de Seleção Recorrente Fenotípica (SRF), sem introdução do gene opaco. Foram realizados quatro ciclos de SRF em duas populações, IG-1 e IG-2, para o teor de triptofano nos grãos, com 20% de intensidade. Os quatro ciclos seletivos e as populações originais foram avaliados para caracteres agronômicos em três locais. Para avaliação da qualidade protéica, foi conduzido um experimento com controle da polinização, para se evitar o efeito de xênia. Houve pequeno aumento nos níveis de triptofano para IG-1 (cerca de 0,70% por ciclo) e ausência de alteração em IG-2. Ocorreu aumento na relação triptofano/proteína para IG-1 (1,26% por ciclo) e os teores de proteína não se alteraram para as duas populações. A qualidade protéica da testemunha ESALQ VD2-opaco foi superior a das populações mesmo após a realização dos quatro ciclos. Como resposta correlacionada à seleção, houve redução na produção de grãos (2,50% por ciclo), prolificidade, altura da planta e altura da espiga. O baixo ganho, associado às alterações desfavoráveis em caracteres agronômicos, indica que este método de seleção possivelmente não é eficiente para elevar a qualidade protéica.

Maize (Zea mays L.) protein is considered to be of low quality due to low levels of the essential lysine and tryptophan amino acids. An alternative to solve this problem is to use the opaque-2 gene, which improves the level of these amino acids, but has negative pleiotropic effects on agronomic characters. A phenotypic recurrent selection scheme was carried out in two non-opaque maize populations to verify the possibility of improving their protein quality without using this gene. Four cycles were completed and a 20% selection intensity for tryptophan content in the kernels was used in two populations, IG-1 and IG-2. The original and the four-cycle populations were evaluated in three locations for agronomic traits. For protein and tryptophan content, a separated trial was carried out because plants of the plots were hand-pollinated. No increase in tryptophan content was observed in the IG-2 population, whereas IG-1 presented a small increase (0.70% per cycle). The ratio tryptophan/protein increased 1.26% per cycle in IG-1 and the protein content did not increase in both populations. The ESALQ-VD2-opaque check was superior in relation to both populations for protein quality, as expected, even after completion of four selection cycles. The kernel yield (2.5% per cycle) prolificacy, plant and ear heights, decreased with selection cycles, as a correlated response to selection. Phenotypic recurrent selection in non-opaque maize was not able to increase, at reasonable rates, the protein quality of maize kernels.

Os grupos heteróticos são importantes no melhoramento de milho, pois permitem o uso mais eficiente do germoplasma. Assim, o objetivo deste trabalho foi alocar linhagens de milho em grupos heteróticos a partir de estimativas da capacidade específica de combinação. Oito linhagens S3 da população BR-105 e dez da BR-106, foram cruzadas ao nível interpopulacional seguindo um sistema dialélico. Oitenta híbridos simples foram obtidos e avaliados em látices em três ambientes. Foram avaliados os caracteres produção de grãos (PG), altura da planta (AP) e altura da espiga (AE). As estimativas das capacidades geral (CGC) e específica (CEC) de combinação foram obtidas segundo o método 4, modelo I de Griffing. A partir das estimativas de CEC, as linhagens foram alocadas aos respectivos grupos heteróticos utilizando-se o método UPGMA (média aritmética não ponderada) para a construção do dendrograma e a dispersão gráfica pelo método das coordenadas principais. Para PG, as linhagens foram alocadas em quatro grupos heteróticos, sendo dois grupos em cada população. Para AP e AE, o uso das estimativas de CEC não foi eficiente para alocar as linhagens em grupos heteróticos. As análises de agrupamento e de coordenadas principais foram eficientes na alocação das linhagens em grupos heteróticos para PG. Então, como a produção de grãos é a principal característica para o melhoramento de milho, com a alocação das linhagens em quatro grupos heteróticos, os cruzamentos serão direcionados e o processo de melhoramento se tornará mais eficiente, evitando a obtenção e a avaliação de cruzamentos (híbridos) desnecessários.

The heterotic groups are important in maize breeding programs because they allow the most efficient use of the germoplasm. The objective of this research was to allocate maize lines to heterotic groups from estimates of specific combining ability (SCA). Eight and ten S3 lines derived from populations BR-105 and BR-106, respectively, were crossed at interpopulation levels following a diallel system. Eighty single-crosses were obtained and evaluated in lattice designs across three environments. Recorded data consisted of grain yield (GY), plant height (PH) and ear height (EH). Estimates of general and specific combining ability (GCA) and (SGA) were computed according to Griffing's method 4, model I, for all traits. Estimates of SCA were used for principal coordinate analysis (PCO) and for cluster analysis, by using UPGMA (unweighted pair-group method with arithmetical averages) clustering algorithm, to assign the lines to heterotic groups. For the trait GY the lines were allocated to 4 heterotic groups, in which the lines from each population were subdivided in 2 heterotic groups. For the traits PH and EH, the use of the estimates of SCA to assign lines to heterotic groups were not efficient. Cluster analysis and principal coordinate analysis were efficient for the trait GY in allocating maize lines to heterotic groups. Thus, since grain yield is the main trait for the breeding purposes, with the allocation of the lines in 4 heterotic groups, the crosses will be more efficient, avoiding to obtain and evaluate unnecessary (hybrid) crosses.

Índices de seleção normalmente são combinações lineares que permitem a seleção para vários caracteres simultaneamente, promovendo o melhoramento das populações para o seu conjunto de características, sendo adequados a programas de seleção recorrente. Contudo, existem outros tipos de índices não lineares, também conhecidos como não paramétricos, que, por não precisarem de estimativas de parâmetros genéticos e fenotípicos, têm seu uso proposto também para a simples classificação dos indivíduos, não necessariamente em programas de seleção recorrente. Os mais comuns são o índice multiplicativo, o de soma de classificação e o de distância ao ideótipo. O presente trabalho tem por objetivo verificar se esses índices não paramétricos são adequados à seleção de cultivares, ou de genótipos em fase final de experimentação. Para tanto, utilizaram-se os resultados do Ensaio Nacional de Milho Precoce 1996/97, da EMBRAPA. Obtiveram-se as médias ajustadas para 49 híbridos, avaliados em nove locais, para os caracteres produção de espigas (kg.ha-1), umidade (%), número de dias para florescimento, altura da planta (cm), altura da espiga (cm), prolificidade e porcentagem de plantas acamadas e quebradas. Foram calculados parâmetros de estabilidade e adaptabilidade, também incluídos nos índices. Os resultados mostraram que os índices revistos não são adequados à seleção de cultivares, por não priorizarem os caracteres mais importantes, não permitirem o descarte dos genótipos com níveis inferiores para algumas variáveis e não preverem a realização de testes de médias.

Selection indices are, usually, linear combinations which allow simultaneous selection from several characters, being quite proper for recurrent selection schemes.Other non-linear-indices (multiplicative, sum of classification and distance to the ideotype) are also available, which do not depend on genetic or phenotypic trait estimates but might be used for genotype ranking. The main aim of this research work has been to establish the feasibility of using those non-linear indices in the end of a breeding program (selection of new cultivars). Data of 49 hybrids from Brazilian Early-Flowering Maize Trials (1996/97), carried out at nine locations, have ben utilized (adjusted means for the variables ear weiht, grain humidity per cent, days-to-flowering, plant height, ear height and percentage of broken and lodged plants). Stability and adaptability parameters have been calculated as well. Results have shown that the indices studied are not suitable for cultivar selection due to the following facts: a) they do not priorize the most important traits; b) do not allow the discarding of low value genotypes and c) cannot be used for multiple comparisons.